Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms