Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdc34Q8CFI2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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