Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfrp1Q8BXL7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms