Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DZIP3Q86Y13 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms