Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms