Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IfnkQ7TSL0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnkQ7TSL0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms