Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms