Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LBX2Q6XYB7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms