Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF6Q6KF10 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms