Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Specc1Q5SXY1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms