Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms