Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms