Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms