Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC1LQ4VXU2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms