Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc55Q3UY51 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms