Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms