Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cnn1Q08091 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cnn1Q08091 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cnn1Q08091 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cnn1Q08091 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cnn1Q08091 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cnn1Q08091 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn1Q08091 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms