Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf4Q06507 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms