Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms