Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms