Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms