Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis3P97368 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Meis3P97368 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms