Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vgll3P85442 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms