Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gjb6P70689 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms