Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ufd1P70362 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms