Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrig1P70193 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms