Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SbdsP70122 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SbdsP70122 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SbdsP70122 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SbdsP70122 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SbdsP70122 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms