Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chp1P61022 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chp1P61022 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Chp1P61022 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chp1P61022 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chp1P61022 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Chp1P61022 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chp1P61022 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Chp1P61022 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chp1P61022 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chp1P61022 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chp1P61022 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chp1P61022 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chp1P61022 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chp1P61022 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chp1P61022 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chp1P61022 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chp1P61022 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chp1P61022 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chp1P61022 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chp1P61022 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chp1P61022 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chp1P61022 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chp1P61022 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chp1P61022 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chp1P61022 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chp1P61022 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms