Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Romo1P60603 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms