Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CckbrP56481 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms