Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad23aP54726 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rad23aP54726 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23aP54726 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23aP54726 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rad23aP54726 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23aP54726 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23aP54726 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23aP54726 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23aP54726 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23aP54726 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23aP54726 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23aP54726 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23aP54726 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23aP54726 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23aP54726 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23aP54726 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23aP54726 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23aP54726 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23aP54726 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23aP54726 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23aP54726 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23aP54726 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23aP54726 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23aP54726 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23aP54726 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23aP54726 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23aP54726 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23aP54726 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23aP54726 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23aP54726 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23aP54726 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23aP54726 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23aP54726 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23aP54726 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23aP54726 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23aP54726 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23aP54726 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23aP54726 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23aP54726 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23aP54726 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms