Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	CNA1	YLR433C	1662 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	CUS1	YMR240C	1311 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	ABD1	YBR236C	1311 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	ARO9	YHR137W	1542 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	ECM22	YLR228C	2445 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	TCM62	YBR044C	1719 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.4	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	TMN2	YDR107C	2019 nt		4.4	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	TYW1	YPL207W	2433 nt		4.4	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	RPP1A	YDL081C	321 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	COS7	YDL248W	1152 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	RPS13	YDR064W	456 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	RRP45	YDR280W	918 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YDR282C	YDR282C	1245 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YER085C	YER085C	522 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	RNA15	YGL044C	891 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	RTA1	YGR213C	954 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	DCD1	YHR144C	939 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	GVP36	YIL041W	981 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	COS5	YJR161C	1152 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	OMA1	YKR087C	1038 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YLR156W	YLR156W	345 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YLR159W	YLR159W	345 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YLR161W	YLR161W	345 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	APS1	YLR170C	471 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YNL134C	YNL134C	1131 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	SAP4	YGL229C	2457 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.4	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	TGL1	YKL140W	1647 nt		4.39	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YDR444W	YDR444W	2064 nt		4.39	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	GGA1	YDR358W	1674 nt		4.39	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	GAS5	YOL030W	1455 nt		4.39	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	DOS2	YDR068W	933 nt		4.39	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	HSP31	YDR533C	714 nt		4.39	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	CDA2	YLR308W	939 nt		4.39	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	MET16	YPR167C	786 nt		4.39	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	TUB2	YFL037W	1374 nt		4.39	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	MTC1	YJL123C	1437 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	FMP30	YPL103C	1407 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	UBP6	YFR010W	1500 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	MIS1	YBR084W	2928 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	PER1	YCR044C	1074 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	CPR4	YCR069W	957 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	SNA2	YDR525W-A	240 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YFL041W-A	YFL041W-A	192 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YHL045W	YHL045W	348 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	ATP12	YJL180C	978 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	EMG1	YLR186W	759 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	ATG14	YBR128C	1035 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YPK3	YBR028C	1578 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	SIR1	YKR101W	1965 nt		4.38	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	TRK1	YJL129C	3708 nt		4.37	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	GRX6	YDL010W	696 nt		4.37	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	ARG82	YDR173C	1068 nt		4.37	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.37	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	SKG1	YKR100C	1068 nt		4.37	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	ZPR1	YGR211W	1461 nt		4.37	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	SPT23	YKL020C	3249 nt		4.36	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	PHO92	YDR374C	921 nt		4.36	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YGR015C	YGR015C	987 nt		4.36	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YPL025C	YPL025C	558 nt		4.36	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		4.36	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	BSD2	YBR290W	966 nt		4.36	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	PIM1	YBL022C	3402 nt		4.36	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	GRS2	YPR081C	1857 nt		4.36	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	ATG2	YNL242W	4779 nt		4.36	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	CDC14	YFR028C	1656 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	RPO31	YOR116C	4383 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YFL064C	YFL064C	525 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	SCL1	YGL011C	759 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YGL188C	YGL188C	174 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	CIR1	YGR207C	786 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	SAY1	YGR263C	1275 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	DAL3	YIR032C	588 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	SPC3	YLR066W	555 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YMR306C-A	YMR306C-A	390 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YBL077W	YBL077W	432 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	PFA4	YOL003C	1137 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	GPI2	YPL076W	843 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YPR202W	YPR202W	717 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	VPS45	YGL095C	1734 nt		4.35	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	PRR2	YDL214C	2100 nt		4.34	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	MPC1	YGL080W	393 nt		4.34	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YGL199C	YGL199C	471 nt		4.34	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	LSO1	YJR005C-A	282 nt		4.34	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	OAR1	YKL055C	837 nt		4.34	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YNL217W	YNL217W	981 nt		4.34	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	HRT1	YOL133W	366 nt		4.34	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	YPL114W	YPL114W	420 nt		4.34	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	CBF5	YLR175W	1452 nt		4.34	□□□□□ -1.71
DSL1	P53847	KIP3	YGL216W	2418 nt		4.34	□□□□□ -1.72
DSL1	P53847	GAL11	YOL051W	3246 nt		4.34	□□□□□ -1.72
DSL1	P53847	RIA1	YNL163C	3333 nt		4.33	□□□□□ -1.72
DSL1	P53847	RGP1	YDR137W	1992 nt		4.33	□□□□□ -1.72
DSL1	P53847	DBP3	YGL078C	1572 nt		4.33	□□□□□ -1.72
DSL1	P53847	DRN1	YGR093W	1524 nt		4.33	□□□□□ -1.72
DSL1	P53847	VPS73	YGL104C	1461 nt		4.33	□□□□□ -1.72

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