Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms