Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx1P48377 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx1P48377 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms