Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB2P47870 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms