Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11bP46638 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11bP46638 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms