Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5cP35278 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5cP35278 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms