Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms