Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TbpP29037 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TbpP29037 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TbpP29037 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TbpP29037 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TbpP29037 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TbpP29037 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TbpP29037 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TbpP29037 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TbpP29037 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TbpP29037 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TbpP29037 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TbpP29037 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TbpP29037 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TbpP29037 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TbpP29037 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TbpP29037 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TbpP29037 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TbpP29037 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TbpP29037 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TbpP29037 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TbpP29037 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TbpP29037 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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