Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou2f1P25425 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou2f1P25425 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou2f1P25425 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou2f1P25425 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou2f1P25425 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou2f1P25425 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou2f1P25425 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms