Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMPD1P17405 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms