Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKBP12277 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKBP12277 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKBP12277 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKBP12277 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKBP12277 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKBP12277 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKBP12277 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKBP12277 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKBP12277 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKBP12277 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKBP12277 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKBP12277 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKBP12277 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKBP12277 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKBP12277 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKBP12277 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKBP12277 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKBP12277 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKBP12277 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKBP12277 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKBP12277 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKBP12277 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKBP12277 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKBP12277 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKBP12277 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKBP12277 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKBP12277 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKBP12277 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CKBP12277 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKBP12277 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKBP12277 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKBP12277 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKBP12277 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKBP12277 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKBP12277 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKBP12277 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKBP12277 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKBP12277 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKBP12277 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKBP12277 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKBP12277 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKBP12277 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKBP12277 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKBP12277 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKBP12277 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms