Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms