Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01724 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01724 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01724 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01724 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01724 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01724 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01724 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01724 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01724 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01724 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01724 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01724 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01724 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01724 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01724 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01724 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01724 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01724 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01724 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01724 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01724 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01724 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01724 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01724 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01724 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01724 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01724 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms