Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igk-V19-17P01633 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Igk-V19-17P01633 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Igk-V19-17P01633 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Igk-V19-17P01633 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igk-V19-17P01633 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms