Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMTA2O94983 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA2O94983 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms