Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UFL1O94874 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UFL1O94874 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UFL1O94874 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UFL1O94874 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UFL1O94874 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UFL1O94874 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UFL1O94874 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UFL1O94874 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UFL1O94874 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UFL1O94874 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UFL1O94874 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UFL1O94874 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UFL1O94874 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UFL1O94874 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UFL1O94874 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UFL1O94874 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UFL1O94874 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UFL1O94874 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UFL1O94874 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UFL1O94874 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UFL1O94874 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UFL1O94874 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UFL1O94874 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UFL1O94874 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UFL1O94874 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UFL1O94874 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UFL1O94874 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UFL1O94874 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UFL1O94874 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UFL1O94874 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UFL1O94874 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UFL1O94874 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UFL1O94874 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UFL1O94874 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UFL1O94874 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms