Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb3O35393 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb3O35393 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms