Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn4O35054 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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