Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SETD1AO15047 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1AO15047 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms